Η κακοκαιρία οδήγησε σε αναβολές αρκετών αναμετρήσεων του Κυπέλλου Ελλάδας, δημιουργώντας πολλές εκκρεμότητες.
Αξίζει να σημειωθεί ότι, όπως επισημαίνεται, «οι ημερομηνίες διεξαγωγής των αγώνων Ξάνθη-ΟΦΗ και Πλατανιάς-ΠΑΣ Γιάννινα, δεν ανακοινώνονται καθώς εκκρεμούν για τους δύο αγώνες σχετικές αποφάσεις της Πειθαρχικής Επιτροπής της ΕΠΟ (δικάσιμος 19/1/2017)».
Αναλυτικά το νέο πρόγραμμα:
3η φάση, 1η αγωνιστική
Λεβαδειακός-ΑΕΚ: 25/1/2017, ώρα 15:00, Λιβαδειάς
Λαμία-Ατρόμητος: 25/1/2017, ώρα 17:15, ΔΑΚ Λαμίας
Άρης-Ολυμπιακός: 25/1/2017, ώρα 19:30, Κλ. Βικελίδης
3η φάση, 2η αγωνιστική
Αστέρας Τρίπολης-Τρίκαλα: 25/1/2017, ώρα 17:15, Θ. Κολοκοτρώνης
ΠΑΟΚ-Παναιτωλικός: 26/1/2017, ώρα 17:15, Τούμπας
Κισσαμικός-Παναθηναϊκός: 26/1/2017, ώρα 19:30, Περιβολίων